德克薩斯大學阿靈頓分校（UTA）的研究人員開發了一種名為BIT（基於表觀基因組學查詢區域集的轉錄調控因子貝葉斯識別）的新型計算工具。此工具幫助科學家辨識控制基因表達的蛋白質，即轉錄調控因子（TRs）。TRs是許多生物過程的關鍵，包括生長、發育和疾病。 BIT使用一種稱為貝葉斯分層建模的方法。此方法評估不同類型證據的概率，使科學家能夠更準確地辨識TRs，即使在多個TRs同時活躍的複雜情況下也是如此。該工具整合了大量數據，以顯示哪些調控因子是活躍的以及它們如何工作。這項研究於2024年6月發表在《自然通訊》雜誌上。 當TRs無法正常工作時，它們可能導致癌症等健康問題。BIT可以幫助研究人員找到對腫瘤生存至關重要的TRs。這可能導致新的治療方法，靶向特定的TRs以阻止腫瘤生長。該工具還可以幫助研究代謝紊亂和心臟病。BIT的開發突顯了機器學習和高級統計學在現代研究中的重要性。這項研究得到了美國國立衛生研究院和德克薩斯州癌症預防與研究中心的支持。
新型計算工具BIT藉由辨識轉錄調控因子輔助基因研究
编辑者： Elena HealthEnergy
來源
Technology Networks
Bayesian Learning Enhances Accuracy in Gene Research - Bioengineer.org
ZeyuL01/BIT: Bayesian Identification of Transcriptional regulators - GitHub
PMC - BIT: Bayesian Identification of Transcriptional Regulators from Epigenomics-Based Query Region Sets
Biomedical Computing and Intelligent Systems Laboratory - College of Engineering - The University of Texas at Arlington
Biomedical Research in AI and Neuroimaging Laboratory - The University of Texas at Arlington
Integrative Immunology Laboratory - The University of Texas at Arlington
Computational Data Science Lab - The University of Texas at Arlington
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