研究人員開發了一種新的計算工具 scMINER，旨在全面分析單細胞 RNA 測序 (scRNA-seq) 數據。該工具通過用戶友好的界面，促進數據預處理、聚類、網絡推斷和可視化。ScMINER 旨在幫助研究人員識別單個細胞內的關鍵基因和信號通路，從而深入了解細胞機制。
ScMINER 使用互信息來測量細胞之間的距離，從而實現精確的聚類和基因網絡的逆向工程。與其他方法不同，ScMINER 不依賴於結合基序，從而可以評估來自 scRNA-seq 實驗的 6,000 多個轉錄和信號驅動因素的活性。該工具還包括一個基於網絡的入口網站，用於探索和共享 scRNA-seq 數據。
基準測試表明，scMINER 在區分不同類型的 T 細胞以及準確重建轉錄因子調控網絡和信號網絡方面優於現有算法。這使得 scMINER 成為研究人員剖析複雜細胞過程和識別單細胞組學數據中隱藏驅動因素的寶貴資產。該軟體可公開訪問。