新框架透過評估種子庫基因多樣性,助力植物保育優先排序

编辑者: Katia Remezova Cath

一項全新開放原始碼框架協助保育專家評估種子庫中基因多樣性的代表性,有助於保護面臨滅絕風險的植物物種。這對於維護生態系統以及確保我們糧食系統的韌性至關重要。

隨著氣候變遷與棲地流失加劇,許多植物物種正面臨滅絕危機。種子庫與植物園在保存植物基因多樣性方面扮演關鍵角色。然而,現有的離域保育(ex situ conservation)中,野生植物物種的代表性不足,僅有不到20%。

摩洛哥穆罕默德六世理工大學(UM6P)的博士研究員Marwa El Graoui開發了一套框架,利用公開資料、地理空間模型及使用者友善的軟體,評估種子庫中基因多樣性的代表性,協助研究人員優先保護急需關注的物種。

El Graoui的研究聚焦於豇豆屬(Vigna),但此方法可應用於任何植物群。該框架以樣本間的地理及環境距離作為基因差異的替代指標,特別是在缺乏直接基因組資料時。此方法基於「距離隔離」理論,即距離較遠的族群基因上較易分化。

為準確界定物種分布範圍,El Graoui與合著者提出「調整範圍」方法,結合包含緩衝區以涵蓋已記錄的出現區域,及排除緩衝區以剔除物種分布模型(SDMs)預測的非合理區域。團隊亦針對離域採集紀錄中的資料不準確問題提出解決方案,因其對保育評估影響甚鉅。

整套流程被包裝成開放原始碼的R語言函式庫,方便全球研究者使用。使用者只需輸入出現座標與氣候變數,即可產生各物種的保育評分。此開放原始碼策略與UM6P利用數位工具及非洲資料解決全球挑戰的願景相契合。

此創新框架提供一個實用工具,提升種子庫中基因多樣性的代表性,為植物保育這項迫切議題提供可擴展且易於取得的解決方案,造福生態系統與人類社會。透過改善基因多樣性的代表性,我們能更有效保護植物物種,並確保未來世代糧食系統的韌性。

來源

  • Morocco World News

  • TransforMed - Agroforestry platform at the experimental farm, University Mohammed VI Polytechnic (UM6P), Morocco

  • Continued partnership with Mohammed VI Polytechnic University

  • AgBS - Post-Doctoral Fellow in Crop Improvement and Plant Physiology job with MOHAMMED VI POLYTECHNIC UNIVERSITY | 386364

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