研究腸道微生物群的厭氧培養技術進展

微生物群研究正在改變疾病治療和環境解決方案。培養微生物對於描述它們和定義它們的功能至關重要。它還允許進行受控實驗，以驗證分子數據預測。目前的厭氧培養技術自 20 世紀 60 年代以來就已經存在，但新的策略正在改進它們。 高通量厭氧培養方法面臨實施挑戰。然而，它們可以產生科學突破，尤其是在腸道微生物群研究中。腸道微生物群對人類健康至關重要，並且主要由厭氧微生物組成。下一代培養方法可以將該領域從關聯性研究轉變為因果性研究。 科學家們已經分離腸道細菌 60 年了。'Culturomics' 在 2010 年代初出現，旨在解決培養微生物比例低的問題。MALDI-TOF 質譜法有助於快速分離鑑定。然而，大多數 culturomics 方法仍然是手動的，通量較低。 很大一部分細菌仍未被描述（腸道環境中為 30-60%）。即使對於已描述的分類群，大多數功能也定義不清。這些微生物未知數挑戰了基於微生物群的創新。了解單個宿主中的菌株進化至關重要，控制儲存以防止體外培養期間的功能喪失也很重要。 創新的厭氧培養方法面臨著長期存在的挑戰。我們現在擁有克服它們的知識和技術。規模化的技術可以促進分離、鑑定和儲存。特定的平台可以改善難培養物種的培養條件，從而實現多重功能比較、高分辨率分析和基因編輯。