麻省理工学院人工智能模型ChromoGen革新3D基因组结构预测,加速基因研究

Edited by: MARIА Mariamarina0506

麻省理工学院的研究人员开发了ChromoGen,这是一种突破性的人工智能模型,可以快速预测基因组的3D结构。这项任务以前需要数周时间,现在只需几分钟即可完成。这项创新在Science Advances中进行了详细介绍,它将深度学习与生成式人工智能相结合,分析DNA序列和染色质可及性,从而能够快速生成数千个染色质结构。

基因组的3D结构决定了基因表达和细胞多样性。ChromoGen使用一个由两部分组成的系统:一部分分析DNA序列,另一部分是生成式人工智能组件,它基于超过1100万个染色质构象的训练集来预测3D结构。这使得研究人员能够更有效地研究3D基因组组织如何影响基因表达和细胞功能。

由麻省理工学院化学副教授张斌领导的团队的人工智能模型可以在几分钟内预测数千个染色质结构,比目前的实验技术快得多。该模型的预测与实验数据一致,并能准确预测来自其他细胞类型的数据,使其成为探索染色质变异及其功能影响的宝贵工具。研究人员已将其模型和数据公开发布,邀请进一步的科学探索。

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