研究肠道微生物群的厌氧培养技术进展

微生物群研究正在改变疾病治疗和环境解决方案。培养微生物对于描述它们和定义它们的功能至关重要。它还允许进行受控实验，以验证分子数据预测。目前的厌氧培养技术自 20 世纪 60 年代以来就已经存在，但新的策略正在改进它们。 高通量厌氧培养方法面临实施挑战。然而，它们可以产生科学突破，尤其是在肠道微生物群研究中。肠道微生物群对人类健康至关重要，并且主要由厌氧微生物组成。下一代培养方法可以将该领域从关联性研究转变为因果性研究。 科学家们已经分离肠道细菌 60 年了。'Culturomics' 在 2010 年代初出现，旨在解决培养微生物比例低的问题。MALDI-TOF 质谱法有助于快速分离鉴定。然而，大多数 culturomics 方法仍然是手动的，通量较低。 很大一部分细菌仍未被描述（肠道环境中为 30-60%）。即使对于已描述的分类群，大多数功能也定义不清。这些微生物未知数挑战了基于微生物群的创新。了解单个宿主中的菌株进化至关重要，控制存储以防止体外培养期间的功能丧失也很重要。 创新的厌氧培养方法面临着长期存在的挑战。我们现在拥有克服它们的知识和技术。规模化的技术可以促进分离、鉴定和储存。特定的平台可以改善难培养物种的培养条件，从而实现多重功能比较、高分辨率分析和基因编辑。