一种名为“地理祖先推断算法”(GAIA) 的新算法通过追踪穿越地理空间和时间的路径来重建人类遗传变异。
GAIA 发表在《科学》* 杂志上,它可以通过提供替代方法来解释共同祖先并提供有关局部适应基因座的信息,从而提高全基因组关联研究的准确性。
现代基因组继承了在不同时间居住在不同地理位置的祖先的遗传相关性的空间模式。 了解这些模式对于识别可观察到的差异和人口历史的基因组基础至关重要。 传统的分析依赖于人类在区域人口中统一选择生殖伙伴的假设。 GAIA 以更少的假设推断出每个共同祖先的时间和地理位置。 它准确地恢复了欧洲、亚洲和非洲的主要人口流动,证明了它们起源于非洲。
研究人员表示,研究谱系地理的能力预示着群体遗传学领域的能力将迎来令人兴奋的增长,从而阐明控制个体在空间和时间中的运动、分布和密度的群体生态过程。
麦吉尔大学的 Simon Gravel 博士指出,GAIA 具有识别人类多样性模型中关键差距的潜力。
* Michael C. Grundler et al., A geographic history of human genetic ancestry. Science 387, 1391-1397 (2025).