Des chercheurs de l'Université de Californie à San Diego ont développé un nouvel outil appelé ROADIES. Cet outil simplifie le processus d'inférence des arbres d'espèces à partir de données génomiques brutes. Il réduit la dépendance à l'expertise du domaine et aux ressources informatiques.
ROADIES automatise le processus d'inférence des arbres d'espèces, le rendant plus accessible aux scientifiques. L'outil utilise un échantillonnage aléatoire de loci à partir des génomes d'entrée, éliminant ainsi le besoin d'annotation du génome. Cette approche réduit également la puissance de calcul requise.
Les chercheurs ont démontré que ROADIES produit des résultats comparables aux études de pointe. Il le fait en une fraction du temps et des efforts. ROADIES peut être utilisé pour n'importe quelle espèce et est évolutif pour les ensembles de données contenant des centaines de génomes.
Les chercheurs s'efforcent d'améliorer encore les capacités de ROADIES. Cela inclut le placement de nouveaux taxons sur les arbres d'espèces existants. Ils explorent également l'utilisation de GPU pour traiter des ensembles de données plus volumineux.
Cet article est basé sur l'analyse de notre auteur de documents provenant de la ressource suivante : Mirage.News.