Neues Computerwerkzeug BIT unterstützt die Genforschung durch Identifizierung von Transkriptionsregulatoren

Forscher der University of Texas at Arlington (UTA) haben ein neues Computerwerkzeug namens BIT (Bayesian Identification of Transcriptional Regulators from Epigenomics-Based Query Regions Sets) entwickelt. Dieses Werkzeug hilft Wissenschaftlern, Proteine zu identifizieren, die als Transkriptionsregulatoren (TRs) bekannt sind und die Genexpression steuern. TRs sind der Schlüssel zu vielen biologischen Prozessen, einschließlich Wachstum, Entwicklung und Krankheit. BIT verwendet eine Methode namens Bayes'sche hierarchische Modellierung. Dieser Ansatz bewertet Wahrscheinlichkeiten über verschiedene Arten von Beweisen hinweg und ermöglicht es Wissenschaftlern, TRs genauer zu identifizieren, selbst in komplexen Situationen, in denen mehrere TRs gleichzeitig aktiv sind. Das Werkzeug integriert große Datenmengen, um zu zeigen, welche Regulatoren aktiv sind und wie sie arbeiten. Die Studie wurde im Juni 2024 in der Zeitschrift *Nature Communications* veröffentlicht. Wenn TRs nicht richtig funktionieren, können sie Gesundheitsprobleme wie Krebs verursachen. BIT kann Forschern helfen, TRs zu finden, die für das Überleben von Tumoren wichtig sind. Dies könnte zu neuen Behandlungen führen, die auf bestimmte TRs abzielen, um das Tumorwachstum zu stoppen. Das Werkzeug kann auch bei der Untersuchung von Stoffwechselstörungen und Herzerkrankungen helfen. Die Entwicklung von BIT unterstreicht die Bedeutung von maschinellem Lernen und fortgeschrittener Statistik in der modernen Forschung. Die Forschung wurde von den National Institutes of Health und dem Cancer Prevention and Research Institute of Texas unterstützt.